Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scn1bP97952 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms