Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gbx1P82976 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms