Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tp53bp1P70399 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Tp53bp1P70399 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms