Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SbdsP70122 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbdsP70122 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SbdsP70122 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SbdsP70122 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SbdsP70122 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SbdsP70122 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SbdsP70122 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SbdsP70122 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SbdsP70122 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms