Protein–RNA interactions for Protein: P68037

Ube2l3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2l3P68037 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2l3P68037 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms