Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crip1P63254 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crip1P63254 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crip1P63254 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crip1P63254 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Crip1P63254 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Crip1P63254 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Crip1P63254 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Crip1P63254 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Crip1P63254 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crip1P63254 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crip1P63254 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crip1P63254 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Crip1P63254 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crip1P63254 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crip1P63254 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crip1P63254 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crip1P63254 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Crip1P63254 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Crip1P63254 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crip1P63254 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Crip1P63254 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crip1P63254 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Crip1P63254 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crip1P63254 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crip1P63254 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crip1P63254 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Crip1P63254 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crip1P63254 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crip1P63254 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crip1P63254 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crip1P63254 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crip1P63254 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Crip1P63254 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crip1P63254 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crip1P63254 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Crip1P63254 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Crip1P63254 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Crip1P63254 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crip1P63254 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crip1P63254 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crip1P63254 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Crip1P63254 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crip1P63254 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crip1P63254 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crip1P63254 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crip1P63254 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crip1P63254 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crip1P63254 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crip1P63254 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crip1P63254 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crip1P63254 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Crip1P63254 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms