Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhobP62746 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhobP62746 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhobP62746 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhobP62746 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhobP62746 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhobP62746 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhobP62746 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RhobP62746 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RhobP62746 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhobP62746 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhobP62746 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhobP62746 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhobP62746 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhobP62746 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhobP62746 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RhobP62746 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhobP62746 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhobP62746 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RhobP62746 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhobP62746 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhobP62746 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhobP62746 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhobP62746 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhobP62746 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhobP62746 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhobP62746 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhobP62746 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RhobP62746 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RhobP62746 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhobP62746 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhobP62746 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhobP62746 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhobP62746 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhobP62746 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhobP62746 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhobP62746 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhobP62746 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RhobP62746 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RhobP62746 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhobP62746 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhobP62746 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhobP62746 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhobP62746 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhobP62746 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhobP62746 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhobP62746 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhobP62746 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhobP62746 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhobP62746 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhobP62746 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhobP62746 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhobP62746 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhobP62746 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RhobP62746 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhobP62746 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhobP62746 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RhobP62746 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238.1 ms