Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lsm5P62322 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms