Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ufm1P61961 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ufm1P61961 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms