Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf13P61216 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf13P61216 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf13P61216 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf13P61216 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf13P61216 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Taf13P61216 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf13P61216 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf13P61216 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf13P61216 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms