Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chp1P61022 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chp1P61022 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chp1P61022 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chp1P61022 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chp1P61022 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms