Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ActbP60710 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ActbP60710 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ActbP60710 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ActbP60710 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ActbP60710 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ActbP60710 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ActbP60710 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ActbP60710 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ActbP60710 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ActbP60710 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ActbP60710 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ActbP60710 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ActbP60710 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ActbP60710 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ActbP60710 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ActbP60710 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ActbP60710 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ActbP60710 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ActbP60710 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ActbP60710 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ActbP60710 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ActbP60710 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ActbP60710 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ActbP60710 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ActbP60710 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ActbP60710 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ActbP60710 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ActbP60710 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ActbP60710 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ActbP60710 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ActbP60710 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ActbP60710 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ActbP60710 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ActbP60710 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ActbP60710 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ActbP60710 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ActbP60710 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ActbP60710 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ActbP60710 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ActbP60710 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ActbP60710 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ActbP60710 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ActbP60710 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ActbP60710 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ActbP60710 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ActbP60710 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ActbP60710 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ActbP60710 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ActbP60710 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ActbP60710 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ActbP60710 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ActbP60710 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ActbP60710 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ActbP60710 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ActbP60710 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ActbP60710 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ActbP60710 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ActbP60710 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ActbP60710 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ActbP60710 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ActbP60710 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ActbP60710 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ActbP60710 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ActbP60710 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ActbP60710 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ActbP60710 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ActbP60710 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms