Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrrn4P59383 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrrn4P59383 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms