Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps33bP59016 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Vps33bP59016 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps33bP59016 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms