Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpm2P58774 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpm2P58774 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms