Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PmchP56942 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PmchP56942 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PmchP56942 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PmchP56942 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PmchP56942 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PmchP56942 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmchP56942 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmchP56942 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmchP56942 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmchP56942 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmchP56942 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmchP56942 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmchP56942 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmchP56942 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmchP56942 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PmchP56942 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PmchP56942 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PmchP56942 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PmchP56942 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PmchP56942 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PmchP56942 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmchP56942 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmchP56942 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmchP56942 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PmchP56942 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PmchP56942 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmchP56942 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PmchP56942 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PmchP56942 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PmchP56942 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmchP56942 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmchP56942 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmchP56942 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmchP56942 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmchP56942 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmchP56942 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmchP56942 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmchP56942 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmchP56942 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmchP56942 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmchP56942 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmchP56942 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmchP56942 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmchP56942 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmchP56942 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmchP56942 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms