Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gp1bbP56400 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gp1bbP56400 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms