Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RabggtbP53612 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RabggtbP53612 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RabggtbP53612 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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