Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RoraP51448 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RoraP51448 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RoraP51448 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RoraP51448 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RoraP51448 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RoraP51448 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RoraP51448 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RoraP51448 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RoraP51448 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RoraP51448 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RoraP51448 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RoraP51448 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RoraP51448 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RoraP51448 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RoraP51448 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RoraP51448 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RoraP51448 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RoraP51448 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RoraP51448 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RoraP51448 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RoraP51448 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RoraP51448 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RoraP51448 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RoraP51448 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RoraP51448 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RoraP51448 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RoraP51448 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RoraP51448 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RoraP51448 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RoraP51448 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RoraP51448 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RoraP51448 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RoraP51448 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RoraP51448 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RoraP51448 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RoraP51448 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RoraP51448 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RoraP51448 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RoraP51448 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RoraP51448 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RoraP51448 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RoraP51448 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RoraP51448 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RoraP51448 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RoraP51448 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RoraP51448 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RoraP51448 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RoraP51448 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RoraP51448 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RoraP51448 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RoraP51448 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RoraP51448 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RoraP51448 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RoraP51448 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RoraP51448 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RoraP51448 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RoraP51448 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RoraP51448 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RoraP51448 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RoraP51448 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RoraP51448 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RoraP51448 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RoraP51448 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RoraP51448 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RoraP51448 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms