Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VdrP48281 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VdrP48281 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VdrP48281 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VdrP48281 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VdrP48281 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VdrP48281 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VdrP48281 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VdrP48281 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VdrP48281 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VdrP48281 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VdrP48281 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VdrP48281 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VdrP48281 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VdrP48281 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VdrP48281 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VdrP48281 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VdrP48281 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VdrP48281 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VdrP48281 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VdrP48281 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VdrP48281 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VdrP48281 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VdrP48281 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VdrP48281 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VdrP48281 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VdrP48281 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VdrP48281 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VdrP48281 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VdrP48281 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VdrP48281 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VdrP48281 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VdrP48281 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VdrP48281 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VdrP48281 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VdrP48281 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VdrP48281 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VdrP48281 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VdrP48281 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VdrP48281 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VdrP48281 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VdrP48281 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VdrP48281 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VdrP48281 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VdrP48281 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VdrP48281 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VdrP48281 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VdrP48281 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VdrP48281 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VdrP48281 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VdrP48281 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VdrP48281 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VdrP48281 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VdrP48281 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VdrP48281 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VdrP48281 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VdrP48281 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VdrP48281 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VdrP48281 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VdrP48281 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VdrP48281 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
VdrP48281 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VdrP48281 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VdrP48281 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VdrP48281 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VdrP48281 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VdrP48281 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VdrP48281 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VdrP48281 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VdrP48281 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VdrP48281 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VdrP48281 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VdrP48281 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VdrP48281 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VdrP48281 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VdrP48281 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VdrP48281 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VdrP48281 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VdrP48281 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VdrP48281 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VdrP48281 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
VdrP48281 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VdrP48281 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VdrP48281 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VdrP48281 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
VdrP48281 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VdrP48281 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VdrP48281 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VdrP48281 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VdrP48281 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VdrP48281 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VdrP48281 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VdrP48281 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VdrP48281 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VdrP48281 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VdrP48281 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VdrP48281 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VdrP48281 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VdrP48281 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
VdrP48281 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms