Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RANGAP1P46060 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
RANGAP1P46060 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RANGAP1P46060 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms