Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-2P42580 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms