Protein–RNA interactions for Protein: P42128

Foxk1, Forkhead box protein K1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxk1P42128 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxk1P42128 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxk1P42128 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms