Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl28P41105 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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