Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hoxd11P23813 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd11P23813 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd11P23813 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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