Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csn1s1P19228 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn1s1P19228 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms