Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps6ka1P18653 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rps6ka1P18653 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka1P18653 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms