Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18529 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18529 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18529 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18529 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18529 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18529 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18529 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18529 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18529 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18529 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18529 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18529 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P18529 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18529 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18529 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18529 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18529 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18529 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18529 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P18529 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18529 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P18529 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18529 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18529 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18529 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18529 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18529 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms