Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18528 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18528 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18528 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18528 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18528 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18528 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18528 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18528 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18528 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18528 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18528 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18528 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18528 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18528 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18528 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18528 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18528 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18528 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18528 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18528 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18528 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18528 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18528 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18528 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18528 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P18528 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18528 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18528 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18528 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18528 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18528 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P18528 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18528 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18528 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18528 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18528 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P18528 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P18528 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18528 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18528 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18528 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18528 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18528 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18528 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18528 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18528 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18528 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18528 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18528 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18528 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18528 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P18528 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18528 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18528 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18528 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18528 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18528 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18528 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18528 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18528 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18528 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18528 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18528 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18528 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18528 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18528 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18528 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18528 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18528 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18528 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18528 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P18528 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18528 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18528 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18528 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18528 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18528 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18528 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18528 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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