Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vpreb2P13373 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms