Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd2P13011 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd2P13011 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd2P13011 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd2P13011 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd2P13011 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scd2P13011 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd2P13011 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scd2P13011 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms