Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl1P10146 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccl1P10146 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms