Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfp28P10078 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp28P10078 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp28P10078 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp28P10078 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp28P10078 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms