Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
B2mP01887 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B2mP01887 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B2mP01887 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B2mP01887 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B2mP01887 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B2mP01887 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B2mP01887 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B2mP01887 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B2mP01887 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B2mP01887 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
B2mP01887 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B2mP01887 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
B2mP01887 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
B2mP01887 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
B2mP01887 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
B2mP01887 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B2mP01887 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B2mP01887 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B2mP01887 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B2mP01887 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B2mP01887 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B2mP01887 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B2mP01887 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B2mP01887 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B2mP01887 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B2mP01887 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B2mP01887 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B2mP01887 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B2mP01887 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B2mP01887 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B2mP01887 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B2mP01887 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms