Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ccl20O89093 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ccl20O89093 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ccl20O89093 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccl20O89093 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Ccl20O89093 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ccl20O89093 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ccl20O89093 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ccl20O89093 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Ccl20O89093 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccl20O89093 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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