Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30O88574 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sap30O88574 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Sap30O88574 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sap30O88574 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Sap30O88574 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sap30O88574 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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