Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppfibp2O35711 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppfibp2O35711 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms