Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn1mwO35599 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn1mwO35599 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn1mwO35599 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn1mwO35599 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn1mwO35599 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn1mwO35599 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn1mwO35599 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn1mwO35599 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn1mwO35599 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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