Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cnih1O35372 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cnih1O35372 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cnih1O35372 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cnih1O35372 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih1O35372 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms