Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casq1O09165 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casq1O09165 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casq1O09165 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casq1O09165 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Casq1O09165 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casq1O09165 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Casq1O09165 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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