Protein–RNA interactions for Protein: O09010

Lfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LfngO09010 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LfngO09010 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LfngO09010 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LfngO09010 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LfngO09010 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LfngO09010 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LfngO09010 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LfngO09010 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LfngO09010 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LfngO09010 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LfngO09010 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LfngO09010 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LfngO09010 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LfngO09010 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LfngO09010 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LfngO09010 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LfngO09010 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LfngO09010 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LfngO09010 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LfngO09010 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LfngO09010 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LfngO09010 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LfngO09010 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LfngO09010 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LfngO09010 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LfngO09010 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LfngO09010 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LfngO09010 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LfngO09010 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LfngO09010 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LfngO09010 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LfngO09010 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LfngO09010 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LfngO09010 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LfngO09010 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LfngO09010 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LfngO09010 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LfngO09010 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LfngO09010 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LfngO09010 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LfngO09010 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LfngO09010 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LfngO09010 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LfngO09010 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LfngO09010 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LfngO09010 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LfngO09010 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LfngO09010 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LfngO09010 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LfngO09010 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LfngO09010 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LfngO09010 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LfngO09010 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LfngO09010 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LfngO09010 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LfngO09010 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LfngO09010 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LfngO09010 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LfngO09010 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LfngO09010 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LfngO09010 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LfngO09010 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LfngO09010 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LfngO09010 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LfngO09010 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms