Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltaO08585 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltaO08585 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltaO08585 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CltaO08585 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltaO08585 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltaO08585 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltaO08585 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltaO08585 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltaO08585 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltaO08585 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CltaO08585 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltaO08585 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltaO08585 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltaO08585 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltaO08585 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltaO08585 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CltaO08585 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CltaO08585 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CltaO08585 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltaO08585 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltaO08585 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltaO08585 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltaO08585 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CltaO08585 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltaO08585 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltaO08585 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltaO08585 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltaO08585 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltaO08585 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CltaO08585 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CltaO08585 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CltaO08585 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CltaO08585 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CltaO08585 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CltaO08585 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CltaO08585 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CltaO08585 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CltaO08585 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CltaO08585 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CltaO08585 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CltaO08585 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CltaO08585 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CltaO08585 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CltaO08585 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CltaO08585 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CltaO08585 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CltaO08585 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CltaO08585 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CltaO08585 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CltaO08585 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CltaO08585 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CltaO08585 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CltaO08585 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CltaO08585 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CltaO08585 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CltaO08585 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CltaO08585 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CltaO08585 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CltaO08585 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CltaO08585 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CltaO08585 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CltaO08585 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CltaO08585 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CltaO08585 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CltaO08585 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CltaO08585 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CltaO08585 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CltaO08585 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CltaO08585 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CltaO08585 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CltaO08585 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CltaO08585 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CltaO08585 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CltaO08585 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CltaO08585 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CltaO08585 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CltaO08585 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CltaO08585 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CltaO08585 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CltaO08585 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CltaO08585 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CltaO08585 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CltaO08585 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CltaO08585 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CltaO08585 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CltaO08585 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CltaO08585 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CltaO08585 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CltaO08585 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CltaO08585 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CltaO08585 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CltaO08585 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CltaO08585 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CltaO08585 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CltaO08585 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CltaO08585 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CltaO08585 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CltaO08585 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CltaO08585 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms