Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl4M0QW46 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ascl4M0QW46 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms