Protein–RNA interactions for Protein: K7N693

Gm3043, Predicted gene 10408, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3043K7N693 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3043K7N693 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3043K7N693 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3043K7N693 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms