Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vwa3bJ9JI28 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vwa3bJ9JI28 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms