Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ32

A630076J17Rik, MCG1026332, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630076J17RikJ3QQ32 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A630076J17RikJ3QQ32 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A630076J17RikJ3QQ32 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms