Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccer2J3QPU5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccer2J3QPU5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccer2J3QPU5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms