Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm2035J3QP87 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm2035J3QP87 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2035J3QP87 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2035J3QP87 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2035J3QP87 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2035J3QP87 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2035J3QP87 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2035J3QP87 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2035J3QP87 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2035J3QP87 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2035J3QP87 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2035J3QP87 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm2035J3QP87 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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