Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SprtnG3X912 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SprtnG3X912 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SprtnG3X912 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SprtnG3X912 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SprtnG3X912 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SprtnG3X912 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SprtnG3X912 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SprtnG3X912 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SprtnG3X912 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SprtnG3X912 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SprtnG3X912 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SprtnG3X912 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SprtnG3X912 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SprtnG3X912 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
SprtnG3X912 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SprtnG3X912 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SprtnG3X912 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SprtnG3X912 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SprtnG3X912 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SprtnG3X912 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SprtnG3X912 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SprtnG3X912 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SprtnG3X912 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SprtnG3X912 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SprtnG3X912 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SprtnG3X912 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SprtnG3X912 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SprtnG3X912 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms