Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Srp72F8VQC1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp72F8VQC1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms